由被检验标本或培养物中取材观察细菌形态时，必须使用接种环。接种环系采用一段长约5-8cm硬度适中的镍质电阻丝或特制铂丝，安置在一金属或玻璃棒上制成。无环者则称接种针。接种环或接种针每次使用前后，均须用红外线灭菌器灭菌，即在红外线灭菌器内*烧灼1次，在腔内金属棒或玻璃棒部分亦须转动着用进灭菌。接种环经红外线灭菌器灭菌后，需待冷却后再沾取标本或放置于工作台上，以防烫死微生物和烧损桌面。
红外线灭菌器也可对玻璃材料的微生物培养管进行消毒，此时特别注意管中不能有任何液体和其它物体，以免里面的液体溅出或发生爆炸等危险事故。不染色标本和染色标本观察后，应立即投入消毒液内灭菌，使用过玻片，务须*消除玻片上的染色细菌后再用，否则再次使用时可能做出错误诊断。
受箱内气流干扰和电热管启闭影响较大，对烘箱前后二段风压控制有较高的要求；由于加热的缓和决定箱体长度比热风循环型要长，只能采用整排瓶子推入方法，才使瓶子的升温基本一致，从而能基本确保热穿透指标一致，红外线灭菌器箱内灭菌温度能确保灭菌后瓶子无菌和无热原，箱体内壁材料采用奥氏体不锈钢，内部接缝应采用连续氩弧焊，焊缝必须平整光滑，弯角应园弧过渡，材料折边不能有死角和缝隙。
结构上无盲区，便于清洗和防止尘埃粒子沉积，箱体外表面可采用不锈钢拉丝板或制后抛光；箱体保温性能好，正常使用时外壳表面温升≤室温+12℃(不含进口处)，充填保温材料不得含Cl-，且确保不会污染口服液瓶和箱内空气，结构设计上要考虑温差应力引起箱体的变形。
红外线灭菌器灭菌的温度随蒸汽压力增加而升高，通过增加蒸汽压力，灭菌时间可被大大缩短。因此它是一种有效，使用广泛的灭菌方法。
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